Тем что ИКСИ более травматично, чем ЭКО и менее естественно ( при ЭКО сперматозоиды все таки самостоятельно бегут к яйцеклеткам, при ИКСИ вкалывают один отобранный эмбриологом сперматозоид в яйцеклетку под микроскопом.)